锦纶的单元晶格均属三斜晶系，其原纤之间具有较大的微隙，锦纶色丝并由一些排列不规则的无定形分子所联系，而原纤维则由高侧序度的分子所组成的微原纤堆砌而成；微原纤间可能存在较小的微空隙，并由一些侧序度稍差的分子所联系。
不同锦纶的大分子主链都由碳原子和氮原子相连而成。锦纶色丝在碳原子、氮原子上所附着的原子数量很少，并且没有侧基存在，故分子成伸展的平面锯齿状，相邻分子间可借主链上的=C=O和=NH生成氢键而相互吸引。
常用的锦纶6具有α、β、Υ三种不同晶体，可以形成三种分子链排列密度，其中α晶体稳定，密度较高，为1.235g/㏄,而β和Υ晶体不稳定，在一定条件下，可相互转变。
